אשר כל טוֹב-דעת יודע כי משובשת היא לרוב, הן בשל "תיקוני" הצנזורה הנוצרית אשר בעצת משומדים ראו כי טוב ללחום בלשון ובדעת מאשר בחרב ובגוף; הן משום טעויות דפוס רבות ומשונות; והן מפאת "תיקוני" חכמים, שכל אימת שלא הבינו את לשון הרמב"ם, סיימו "ונראה שצ"ל"; ובאו אחריהם תלמידים הרעים והמחוכמים והחליטו "לתקן" את לשון הרמב"ם והפסידו וקלקלו. דוגמאות אין-ספור יש לכך, ואין סקירתם ממטרות מהדורה זו; ואילו באנו להשוות נוסחתינו לנוסחת דפוס וילנא, היה הקורא מתייגע, ולא מאמין כיצד משפטים שלמים של ה"עורכים" חדרו ללשון רבנו (2), ופעמים רבות נדחקו רבותינו להסביר ולתרץ הנוסחה המשובשת, שלא רק שלא עלתה בקנה אחד עם כוונת רבנו, אלא אף היתה סותרת מקצה לקצה (כאסור ומותר).

(עד כה נדפסו י"ג כרכים מתוך י"ד בהוצאת "בני יוסף", תשל"ה-תשס"ג), עם המפרשים היסודיים ותוספות מועילות. לפני עורכי המהדורה היו דפוסים ראשונים של "משנה תורה" וכתבי יד רבים. עבודתם ההשוואתית בין הנוסחים ראויה לכל הערכה והוקרה (4), אך ההחלטה הסופית להציב לפני הקורא נוסח עיקרי המבוסס על ספרי הדפוס הראשונים, אף אם ברור שהוא שגוי ("נמנענו בדרך כלל מלקבוע בפנים שינוי נוסח משמעותי שאינו מצוי באחד מספרי הדפוס") ולהניח בסוף הכרך, בנבכי "ילקוט שינויי נוסחאות" את נוסח כתבי היד, אף אם ברור שהוא הוא המדויק - מערערת על קביעתם כי "חושבים אנחנו כי זכינו להעמיד את דברי רבנו, כפי שיצאו מתחת ידו". אומנם דפוסים ראשונים אלו (טרם הצנזורה הנוצרית) מבטיחים תוצאה טובה יותר מן הדפוסים האחרונים. אך כפי שכבר העירו רבים, מאי רבותיה דדפוס? וכי מספר המצטטים את הנוסח מהווים ערובה הוא לדיוקו? (5) וכי כל מה שמודפס קדוש ייאמר לו בשל תפוצתו הרבה? (6) וכי הדפוס לא הועתק מכתב יד (ומקור תמיד עדיף על העתק), והלא כמה וכמה דורות (כ-300 שנה) עברו למן הופעת "משנה תורה" ועד להמצאת הדפוס, וכי לא נשתרבבו עד אז טעויות? והלא עוד בימיו של הרמב"ם בשל העתקה מכלי שני ושלישי נתרבו הטעויות לספר כה גדול.
עם זאת, עשינו שימוש בחילופי הנוסח המשמעותיים המוזכרים הן בשולי הדף והן ב"ילקוט שינויי הנוסחאות", אף כפי המלצתם, אשר תובא להלן, כי "כל הרוצה לדון בענייני דקדוק לשונו של רבנו ראוי לו לתפוס עיקר את נוסח תימן כפי שימצאנו במדור שינויי נוסחאות"; הקורא במהדורת פרנקל הבא לממש המלצה זו יתייגע רבות, ולבסוף ילאה וירגיל על לשונו לשון הדפוסים הראשונים, וחבל.

לספרים מדע, אהבה, זמנים, נשים, משפטים וסוף זרעים (הוצאת מעליות, תש"ן-תשס"ד). מהדורה וגילוי מקורות הרמב"ם עם פירוש מקורי המצטרף לשיטת הרמב"ם על פי הרמב"ם. מהדורה זו, שעיקרה הוא הפירוש, בנויה בדרך כלל בהתבסס באופן מוחלט על כתב יד בודד.

עד כה הופיעו שני ספרים: מדע וזרעים (הוצאת שילת, תשס"ה). מהדורת עריכה מדעית על פי מספר כתבי יד בצירוף צילומי עמודים מנוסח דפוס וילנא.

(מצויה באתר האינטרט: www.mechon-mamre.org, המתעדכנת בקביעות) לרב שלמה בן אברהם שליט"א ולצוות תלמידי חכמים שעמו, המבוססת על רוב כתבי יד תימן על פי מהדורות קאפח ופרנקל (ומהדורת ליברמן לספר המדע). חסרונה של מהדורה זו היא בהחלטה על רוב כמותי של הנוסחים (מהדורה אקלקטית) ולא איכותי, בייחוד במקומות שברור (גם מתוך הערות בקאפח ובפרנקל על נוסח זה!), כי הטעות או אי-העדכון נשתכפל (7). אף על פי כן, מהדורתנו קרובה מאוד למהדורה זו, ועל השינויים המשמעותיים הערנו על אתר.